Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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