Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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