Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YER085CYER085C 522 nt6.53□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 FRA2YGL220W 363 nt6.53□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 YJR111CYJR111C 852 nt6.53□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 ERP1YAR002C-A 660 nt6.53□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 YPK2YMR104C 2034 nt6.53□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 APN2YBL019W 1563 nt6.52□□□□□ -1.36
TFB4Q12004 BIK1YCL029C 1323 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 AMN1YBR158W 1650 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CYB2YML054C 1776 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CBP1YJL209W 1965 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 NCB2YDR397C 441 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RGI1YER067W 486 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SOL4YGR248W 768 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YHL037CYHL037C 402 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 QCR10YHR001W-A 234 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CFD1YIL003W 882 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SPC1YJR010C-A 285 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YKL151CYKL151C 1014 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 PRX1YBL064C 786 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 MRPL10YNL284C 969 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YRO2YBR054W 1035 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SMX3YPR182W 261 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 LSG1YGL099W 1923 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SPH1YLR313C 1593 nt6.52□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SSE2YBR169C 2082 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ERG5YMR015C 1617 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SAT4YCR008W 1812 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ATG1YGL180W 2694 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 PRP45YAL032C 1140 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 MRP17YKL003C 396 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YMR122CYMR122C 375 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RIO2YNL207W 1278 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RPA43YOR340C 981 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 MUD2YKL074C 1584 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ECM38YLR299W 1983 nt6.51□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RGD1YBR260C 2001 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YKR078WYKR078W 1758 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 HPT1YDR399W 666 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RPL12AYEL054C 498 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CDC43YGL155W 1131 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 LAG1YHL003C 1236 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YAR023CYAR023C 540 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YMR320WYMR320W 306 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YNL235CYNL235C 432 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RPS19BYNL302C 435 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SRB6YBR253W 366 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 TAE1YBR261C 699 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 PPN1YDR452W 2025 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ARP9YMR033W 1404 nt6.5□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YCT1YLL055W 1596 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 TSR1YDL060W 2367 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ATP8Q0080 147 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CTF8YHR191C 402 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 MRP21YBL090W 534 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 OSW2YLR054C 2175 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 TDP1YBR223C 1635 nt6.49□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 IRS4YKR019C 1848 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 NAM9YNL137C 1461 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 TRM12YML005W 1389 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SDL1YIL167W 633 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 UPS2YLR168C 693 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CUE4YML101C 354 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 COQ5YML110C 924 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SHP1YBL058W 1272 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YNL092WYNL092W 1203 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 MDG1YNL173C 1101 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YNL198CYNL198C 303 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 PDR17YNL264C 1053 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YOR186WYOR186W 435 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CTA1YDR256C 1548 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 ISC1YER019W 1434 nt6.48□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 RRP9YPR137W 1722 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 PBP4YDL053C 558 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SEC20YDR498C 1152 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YER107W-AYER107W-A 321 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YMR315WYMR315W 1050 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SEN54YPL083C 1404 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 TDA3YHR009C 1572 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CRZ1YNL027W 2037 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 YBR241CYBR241C 1467 nt6.47□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 BDF2YDL070W 1917 nt6.46□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 SAC6YDR129C 1929 nt6.46□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 VBA1YMR088C 1689 nt6.46□□□□□ -1.37
TFB4Q12004 CUP2YGL166W 678 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 YJR128WYJR128W 360 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 MRPL31YKL138C 396 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 AIM29YKR074W 468 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 SUB2YDL084W 1341 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 GPD2YOL059W 1323 nt6.46□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 TFB2YPL122C 1542 nt6.45□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 SSL1YLR005W 1386 nt6.45□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 RFT1YBL020W 1725 nt6.45□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 UBP7YIL156W 3216 nt6.45□□□□□ -1.38
TFB4Q12004 YDL109CYDL109C 1944 nt6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms