Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms