Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD47Q08722 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD47Q08722 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms