Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
OCA2Q04671 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OCA2Q04671 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms