Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK17Q00537 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms