Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms