Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms