Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX6P78412 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRX6P78412 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRX6P78412 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX6P78412 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX6P78412 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX6P78412 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX6P78412 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX6P78412 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX6P78412 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRX6P78412 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX6P78412 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX6P78412 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms