Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms