Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00310P59036 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms