Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YBEYP58557 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBEYP58557 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YBEYP58557 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YBEYP58557 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YBEYP58557 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YBEYP58557 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YBEYP58557 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBEYP58557 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YBEYP58557 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBEYP58557 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms