Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLTPP55058 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLTPP55058 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms