Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP13P45452 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP13P45452 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP13P45452 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP13P45452 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms