Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDH1P40925 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDH1P40925 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDH1P40925 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDH1P40925 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDH1P40925 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDH1P40925 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms