Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPGP40121 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPGP40121 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPGP40121 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPGP40121 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CAPGP40121 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms