Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPA9P38646 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA9P38646 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms