Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RYKP34925 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RYKP34925 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYKP34925 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYKP34925 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYKP34925 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RYKP34925 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYKP34925 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYKP34925 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms