Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPOP30536 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSPOP30536 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms