Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TM4SF1P30408 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF1P30408 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms