Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HRCP23327 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HRCP23327 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HRCP23327 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HRCP23327 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HRCP23327 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HRCP23327 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HRCP23327 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HRCP23327 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
HRCP23327 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
HRCP23327 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HRCP23327 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HRCP23327 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HRCP23327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HRCP23327 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HRCP23327 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HRCP23327 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HRCP23327 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
HRCP23327 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms