Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCP2P22307 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2P22307 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2P22307 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2P22307 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SCP2P22307 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2P22307 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCP2P22307 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms