Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF3P15923 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF3P15923 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF3P15923 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF3P15923 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCF3P15923 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF3P15923 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms