Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRAFP15056 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAFP15056 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAFP15056 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRAFP15056 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRAFP15056 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRAFP15056 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRAFP15056 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRAFP15056 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRAFP15056 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRAFP15056 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRAFP15056 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRAFP15056 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms