Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCP1P13796 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCP1P13796 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCP1P13796 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCP1P13796 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCP1P13796 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCP1P13796 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCP1P13796 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms