Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP2P13473 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms