Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms