Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms