Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1O95476 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms