Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP9O75884 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms