Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX16O60231 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX16O60231 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX16O60231 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX16O60231 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX16O60231 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX16O60231 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX16O60231 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX16O60231 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX16O60231 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX16O60231 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
DHX16O60231 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
DHX16O60231 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX16O60231 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms