Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TXNDC9O14530 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TXNDC9O14530 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms