Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms