Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC66A2RUB6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms