Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ITGA6-203ENST00000409532 3544 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MMP2-208ENST00000570308 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ASB9-201ENST00000380483 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SWT1-201ENST00000367500 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MIR874-201ENST00000401190 78 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 OPTN-201ENST00000263036 2464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CORO2B-202ENST00000540068 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 EML1-202ENST00000327921 3715 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL354674.1-201ENST00000585222 1780 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GRIA1-209ENST00000518783 5233 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 DNAJC5G-201ENST00000296097 2008 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 KRT8P46-201ENST00000512037 1426 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CNGA3-201ENST00000272602 3470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 KCNE1B-203ENST00000622690 3149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL442125.1-201ENST00000619092 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC093802.1-201ENST00000407524 3238 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PLA2G2C-202ENST00000429261 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC099494.3-201ENST00000623645 1722 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CHRNA1-201ENST00000261007 1980 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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