Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GRM7-204ENST00000402647 2034 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RABGAP1-213ENST00000616002 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF738-201ENST00000311015 2442 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RAB39B-201ENST00000369454 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AGPAT4-IT1-201ENST00000624499 1878 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ADGRE2-204ENST00000392965 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MYO10-212ENST00000515803 4839 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 THRB-AS1-201ENST00000432368 1216 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01140-210ENST00000590653 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF683-202ENST00000403843 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 POTEJ-201ENST00000409602 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL359532.1-201ENST00000608729 1560 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LRIT2-202ENST00000538192 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF155-207ENST00000590615 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC02125-201ENST00000512279 2198 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CLN3-244ENST00000636147 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL512770.1-202ENST00000421657 1914 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 WDR92-203ENST00000409164 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 USP54-204ENST00000422491 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PPID-201ENST00000307720 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL645998.1-201ENST00000424552 345 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01210-204ENST00000478772 1288 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TCF4-232ENST00000566286 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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