Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MRPL45-204ENST00000619548 1554 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01149-202ENST00000430364 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BORCS7-201ENST00000339834 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DLEC1-202ENST00000346219 5490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KBTBD3-205ENST00000531837 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL590683.1-201ENST00000439059 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PHACTR3-203ENST00000361300 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF583-201ENST00000291598 2538 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL158847.1-201ENST00000431955 808 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CTTNBP2-201ENST00000160373 5970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF567-202ENST00000536254 2825 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BOC-215ENST00000495514 4646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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