Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USH1CQ9Y6N9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USH1CQ9Y6N9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms