Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP16Q9Y5T5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms