Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRBQ9Y5M8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms