Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms