Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms