Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms