Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms