Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms