Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNAL1Q9UBT7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms