Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms