Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms