Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB20Q9NX57 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms